Présentation du master

 



La mention du master « In Silico Drug Design » ou « Innovation thérapeutique assistée par ordinateur à l’interface Chimie Biologie» (créé en 2010) répond à une demande du secteur privé (entreprises pharmaceutiques) et du secteur académique, de former des étudiants pour modéliser les futurs médicaments à l’aide des approches computationnelles (in silico) et accélérer ainsi le processus de recherche de nouvelles molécules thérapeutiques.
Cette mention ISDD à finalité pro et recherche, unique en France et en Europe, complète l’offre de formation en Sciences du Vivant et en Chimie par une formation avec de fortes implications dans le domaine de la Santé dont la clé de voûte est l’interdisciplinarité.
Cette interdisciplinarité s’appuie sur des masters d’excellence de plusieurs universités françaises et européennes (Strasbourg, Paris Diderot, Paris Descartes, Milan), des équipes académiques et du privé d’excellence et la participation de spécialistes internationaux de différents pays.


Ce master «In Silico Drug Design» propose l’ensemble des connaissances complémentaires nécessaires au processus de recherche de nouvelles molécules thérapeutiques, «Drug Discovery» par des approches in silico.
Les étudiants acquièrent des connaissances solides sur les composés chimiques et les cibles thérapeutiques (macromolécules biologiques), des notions de chimie médicinale et de médecine moléculaire ainsi que des compétences sur la modélisation des interactions cibles-molécules chimiques. Ils sont formés à la modélisation, l’analyse et la prédiction des molécules thérapeutiques, des cibles biologiques et des interactions « médicament-cible », aux approches in silico telles que la chemoinformatique, la bioinformatique structurale, le « docking » ou des méthodes d’amarrage moléculaire, le criblage virtuel, les biostatistiques et l’analyse de données.

Ce master propose deux spécialités internationales, qui reposent sur deux M1 distincts et complémentaires :
  • - la spécialité « Design in silico des molécules bioactives, IsMB » qui inclut un semestre d’étude à l’Université degli studi di Milano et propose un double diplôme franco-italien
  • - la spécialité « Analyse in silico des complexes médicaments-macromolécules biologiques, MMiS » qui inclut des interventions d’experts internationaux et un semestre d’étude et/ou de stage à l’étranger
Ces deux spécialités correspondent chacune à 50% des cours en anglais et incluent au moins un semestre à l’étranger.

Ce master forme des professionnels(les) du privé et du public, au niveau français mais ausi européen, acteurs de la recherche par des approches in silico dans le domaine de l’innovation thérapeutique et/ou orientés vers le développement de molécules pharmacologiques.


- Contexte de cette formation :
Les méthodes de Drug Design in silico facilitent la découverte de molécules bioactives, permettent de diminuer les coûts et d’identifier plus rapidement des molécules potentiellement thérapeutiques tout en suivant les nouvelles directives visant à réduire l’expérimentation animale. En effet, ces méthodes rationalisent la découverte de molécules bioactives et de sondes chimiques nécessaires à la compréhension du Vivant et facilitent l’exploration rapide d’un maximum d’hypothèses pour se consacrer aux molécules qui offrent la plus grande probabilité d’atteindre la phase clinique. (*Plusieurs molécules commercialisées sont ainsi nées, en partie, sur un écran d’ordinateur, comme l’oseltamivir (TAMIFLU) et certaines molécules utilisées dans le traitement du SIDA). Elles sont désormais irremplaçables dans l’arsenal des découvreurs de médicaments et forment un domaine de recherche en plein essor en France et en Europe.
Cette mention de master accueille des étudiants de diverses formations initiales (universitaires ou écoles d’ingénieurs) : biochimie, chimie, biologie, biologie-informatique, secteur médical, pharmacie, sciences biomédicales.


Cette formation offre de nombreux débouchés avec une très forte demande sur le marché de l’emploi.
A l’issue de la formation, les étudiants possèdent des connaissances solides sur les composés chimiques et les cibles thérapeutiques, ainsi que des compétences sur la modélisation des interactions cibles-médicaments. Ces compétences offrent des débouchés dans la phase initiale de rationalisation et d’optimisation de la découverte de nouvelles molécules candidates médicaments, dans le développement de nouvelles méthodologies et de logiciels permettant d’accélérer le processus de recherche des nouvelles molécules candidates médicaments.
Ainsi une poursuite en doctorat est possible, mais aussi une insertion directe en milieu professionnel (industrie pharmaceutique ou EPST).

Ce master offre des débouchés dans des industries pharmaceutiques et des « jeunes pousses », des laboratoires de recherche nationaux ou internationaux, privés ou académiques ou leur permet de poursuivre leurs études en effectuant un doctorat français ou international.
Les étudiants obtiennent des postes d’ingénieur, assistant de recherche ou manager directement après le M2 ou en tant que chef de projet, chercheur, responsable de plate-forme, après une thèse. Les débouchés sont à finalité recherche et pro, l’orientation se fait au niveau du choix des stages de recherche en laboratoires académiques ou en entreprises privées.

96% des étudiants sont recrutés dans les 2 années qui suivent leur master.

Dès sa création, le master a choisi d’avoir une forte orientation internationale, car son but est de former des étudiants dans un domaine de recherche en pleine expansion au niveau international et qu’ils puissent s’intégrer dans des projets de recherche internationaux.
La formation internationale du Master (les interventions de professeurs internationaux, les semestres d’étude et de stage à l’étranger, le double diplôme) ouvre très largement les opportunités de débouchés au niveau international, aussi bien en thèse qu’en CDD, mais aussi les opportunités de recrutement en France.

Le camembert illustre la répartition des étudiants en privé et en thèse nationale ou internationale.



Ce master à visée internationale repose sur une co-habilitation Paris Diderot-Strasbourg, une convention avec Paris Descartes et depuis 2015 d’un accord de double diplôme avec l’Université degli Studi di Milano en Italie.

Il propose deux spécialités internationales complémentaires incluant chacune au moins un semestre à l’étranger :
1) une spécialité « Analyse in silico des complexes macromolécules biologiques-médicaments», « MMis » , qui se concentre sur la modélisation des cibles macromolécules biologiques et de leurs interactions avec les médicaments et autres molécules chimiques et inclut des interventions d’experts internationaux et un semestre d’étude et/ou de stage à l’étranger
Dans cette spécialité, les différents semestres 1, 2 et 3 sont effectués à l’université Paris-Diderot (avec la possibilité d’effectuer le semestre 1 à l’université de Strasbourg et le semestre 2 à l’Université degli Studi di Milano en Erasmus) et le semestre 4 en stage d’initiation à la recherche encouragé à l’étranger.

2) une spécialité « Design in silico des molécules bioactives » « IsMB », cohabilitée par l’Université de Strasbourg, dédiée à la modélisation des molécules bioactives et à la chimie pharmaceutique in silico et s’adresse plus particulièrement aux étudiants ayant une formation en chimie et souhaitant acquérir des connaissances approfondies en modélisation des molécules chimiques.
Elle permet l’obtention de deux diplômes, pour les Université Paris Diderot et de Strasbourg : le Master In Silico Drug Design, spécialité Développement in Silico des molécules bioactives et pour l’Università degli Studi di Milano : le Laurea Magistrale in Scienze Chimiche.

Elle propose le semestre 1 à l’université de Strasbourg, le semestre 2 à l’Université degli Studi di Milano puis le semestre 3 à l’université Paris-Diderot et un dernier semestre de stage en France ou à l’étranger.



SPECIALITE « MMis »
« Analyse in silico des complexes macromolécules biologiques-médicaments»

SPECIALITE « IsMB »
Design in silico des molécules bioactives

SEMESTRE 1
Université de Paris Diderot
(Pr O. Taboureau)
CHEMOINFORMATIQUE EN DRUG DESIGN

OU
SEMESTRE 1
Université de Strasbourg
(Pr A. Varnek/Dr G.Marcou)
CHEMOINFORMATIQUE
SEMESTRE 2
Université Paris Diderot
(Pr O. Taboureau)
MACROMOLECULES

OU
SEMESTRE 2 *
Université degli Studi de Milan
(Pr S. Pieraccini/Pr E. Selli)
MOLECULES BIOACTIVES
SEMESTRE 3
Université Paris Diderot & Paris Descartes
(Pr A-C Camproux/ Dr B. Villoutreix/ Dr L. Regad)
DRUG DESIGN et CRIBLAGE IN SILICO
SEMESTRE 4
STAGES A L’ETRANGER *
(Pr A-C Camproux)
En Angleterre, Finlande, Italie, Suède, Danemark, Bulgarie, Australie, Corée, EU, …

SEMESTRE 4
STAGES
(Pr A-C Camproux)


*Les étudiants pourront bénéficier de bourses Erasmus


En terme de logement, les universités participantes proposent des logements en résidence universitaire afin de simplifier la mobilité des étudiants pour les différents semestres de leur master (Voir liens utiles).