Programme :
L'objectif de cet enseignement est de présenter les concepts théoriques avancés, les algorithmes et les programmes associés pour la conception de molécules thérapeutiques par des approches se basant sur la structure de la protéine cible. Prise en compte de la flexibilité de la protéine et du ligand. Comment faire du docking avec des liaisons covalentes ?
Etude de la stabilité par dynamique moléculaire de l’interaction protéine-ligand.
Présentation et utilisation de plusieurs programmes de docking et de criblage virtuel.
Autodock & Rdock, seed (fragment-based), un criblage sur une cible thérapeutique à l’aide @TOME-3

Compétences visées :
Comprendre et maîtriser certains outils bioinformatiques aidant à la conception de molécules thérapeutiques en se basant sur la structure de la protéine cible.