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(Responsable: L. REGAD)
3-projets en Drug Design tutoré (2 ECTS)
(Responsables: L. Regad & O. Taboureau)
Programme :
Une analyse intégrée des résultats des différents projets [combinant la modélisation moléculaire sur une cible pour évaluer sa flexibilité, la sélection des molécules candidates par des approches de filtrage statistique pour créer une chimiothèque optimisée et du criblage virtuel (ligand-based et structure-based) de la cible par ses molécules pour prédire les molécules inhibitrices à partir de la chimiothèque optimisée], sera effectuée par les étudiants afin qu’ils acquièrent une expérience pratique sur un projet de drug design in silico. Cette cible et molécules sont traitées et analysées de façon concrète sous la forme de projets ou compte-rendu durant différents modules du semestre. L’objectif de ce projet et que les étudiants lient les différentes approches étudiées et projets obtenus sur un même système afin de comprendre la complémentarité et la finalité de ces approches pour un projet complet de drug design in silico.
Compétences visées :
Savoir appliquer et analyser et combiner les différentes étapes d’un protocole de drug design Connaitre un protocole de drug design pour identifier de nouveaux inhibiteurs d’une cible d’intérêt En fin de semestre, les étudiants combinent et analysent les résultats des différentes projets obtenus sur un même système cible afin de comprendre la complémentarité et la finalité des approches étudiées dans le tronc commun du M2. Savoir développer un pipeline optimisé pour identifier de nouveaux inhibiteurs d’une cible donnée, optimiser et combiner les différents outils nécessaires dans un protocole de drug design.
Dans le cadre de ce module, selon les années, si le Grand Challenge D3R est proposé, les étudiants ont la possibilité de participer au Grand Challenge D3R, qui correspond au challenge international de Drug Design hébergé par the University of California, San Diego. Son but est de Prédire la position de petites molécules dans le site de liaison d’une protéine donnée et Prédire l’affinité de petites molécules pour cette même protéine. https://drugdesigndata.org/about/grand-challenge
Une analyse intégrée des résultats des différents projets [combinant la modélisation moléculaire sur une cible pour évaluer sa flexibilité, la sélection des molécules candidates par des approches de filtrage statistique pour créer une chimiothèque optimisée et du criblage virtuel (ligand-based et structure-based) de la cible par ses molécules pour prédire les molécules inhibitrices à partir de la chimiothèque optimisée], sera effectuée par les étudiants afin qu’ils acquièrent une expérience pratique sur un projet de drug design in silico. Cette cible et molécules sont traitées et analysées de façon concrète sous la forme de projets ou compte-rendu durant différents modules du semestre. L’objectif de ce projet et que les étudiants lient les différentes approches étudiées et projets obtenus sur un même système afin de comprendre la complémentarité et la finalité de ces approches pour un projet complet de drug design in silico.
Compétences visées :
Savoir appliquer et analyser et combiner les différentes étapes d’un protocole de drug design Connaitre un protocole de drug design pour identifier de nouveaux inhibiteurs d’une cible d’intérêt En fin de semestre, les étudiants combinent et analysent les résultats des différentes projets obtenus sur un même système cible afin de comprendre la complémentarité et la finalité des approches étudiées dans le tronc commun du M2. Savoir développer un pipeline optimisé pour identifier de nouveaux inhibiteurs d’une cible donnée, optimiser et combiner les différents outils nécessaires dans un protocole de drug design.
Dans le cadre de ce module, selon les années, si le Grand Challenge D3R est proposé, les étudiants ont la possibilité de participer au Grand Challenge D3R, qui correspond au challenge international de Drug Design hébergé par the University of California, San Diego. Son but est de Prédire la position de petites molécules dans le site de liaison d’une protéine donnée et Prédire l’affinité de petites molécules pour cette même protéine. https://drugdesigndata.org/about/grand-challenge