Objectifs:
L’objectif de ce module est d’initier les étudiants au domaine de la chemoinformatique et de son application en Drug Design.

Programme :
- Représentation chimique (1D, 2D, 3D)
- Bases de données chimiques
- Les différents formats de fichier molécule, PDB, smile, SMARTS, mol2, MDL-sdf.
- Descripteurs chimiques et pharmacophores.
- Visualisation de descripteurs et molécules
- Les règles de Lipinski
- Similarité des molécules avec le critère de Tanimoto
- Introduction aux méthodes structure- activité (QSAR)
- Représentation et visualisation des molécules chimiques
- Utilisation des packages de R et edragon

Compétences visées :
Initiation à la chémoinformatique. Représentation chimique, descripteurs chimiques et pharmacophores, visualisation. Minimisation / reconstruction. Représentation et visualisation des molécules, application à l’aide de R et edragon. Comprendre si une molécule est un bon candidat médicament.