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List of Internships M2 Year 2012-2013


Last update : 6/3/2013
Title of internships ** Selected internships
Stage 1 : Identification de complexes protéine-protéine à fort potentiel biotechnologiques ou thérapeutiques en combinant des approches statistiques, d’apprentissage et de dynamique moléculaire.  
Stage 2 : Application de la chemoinformatique l’exploitation des voies métaboliques  
Stage 3 : Hydrophobin surface structure modelling ** N. Mele
Stage 4 : Optimizing the hydrogen-bond network in GPCR models. ** C. Gageat
Stage 5 : STRUCTURAL BIOINFORMATICS STUDY OF AMYLASES, CHITINASES AND CELLULASES  
Stage 6 : Application of QSAR methods in the assessment of human health endpoints  
Stage 7 : Propriétés physico/chimies des molécules qui traversent la membrane externe des Pseudomonas aeruginosa à l’aide des porines  
Stage 8 : Structural properties of efflux pumps belonging to RND and SMR families : homology modelling  
Stage 9 : Targetting of Annexin A5 through structure-based virtual ligand screening.  
Stage 10 : Application de la chémoinformatique l’exploitation des voies métaboliques  
Stage 11 : New inhibitors for Cytochrome P450 17A1 – A Potential Anti-Cancer Target  
Stage 12 : Tightened End Fragments (TEF) as inhibitors of protein-protein interactions
Stage 13 : Vers l’automatisation de la prédiction de l’interactome
Stage 14 : Etude de l’effet de la flexibilité et des mutations des protéines kinases sur l’activité biologique
Stage 15 : Développement de modèles par homologie de cibles thérapeutiques impliquées dans la glycobiologie ** Stéphanie Eustache
Stage 16 : Optimization of pyDock for inhibitor prediction and flexible docking. ** D. Triki
Stage 17 : Simulation par DM, tout-atome ou gros-grains, de biomolécules en milieu membranaire ** M.A. Angladon
Stage 18 : Développement d’une librairie virtuelle de produits naturels et son utilisation dans le criblage virtuel sur des cibles d’intérêt thérapeutique ** V. Lancelot
Stage 19 : Dynamique du nucléosome ** Ahmad ELBAHNSI
Stage 20 : In silico prediction of GPCR-ligand interactions ** Viviane Chastagner
Stage 21 : Application of molecular dynamic simulations (MD) and replica exchange molecular dynamics (REMD) to study the cross-talk of PARP-1 domains in presence and absence of small molecule inhibitor. ** Jean Rémy Marchand
Stage 22 : Développement et optimisation d’un modèle de pénétration cutanée des molécules ** Stéphane Azoulay
Stage 23 : Computational Chemistry of Histone Lysine Demethylases Inhibitors ** Philibert Malbranche
Stage 24 : Modeling study of pyronetine-vinblastine hybrid systems
Stage 25 : Mise en application des méthodes enseignées lors du master à la détermination précise et reproductible des affinités théoriques ** Jérémy Verdière
Stage 26 : Etude des propriétés de transport de la protéine RhCG par des calculs d’énergie libre et évaluation de l’impact des mutations ** Debbia Benkerrou
Stage 27 : Benchmarking of Harmonic Pharma proprietary pocket detection program. ** Figen Kabadas
Stage 28 : Etude de la dynamique du microtubule en présence d’agents stabilisants ou déstabilisants. ** Marroun Sami
Stage 29 : Parallélisation du criblage virtuel appliqué simultanément aux protéines d’une même famille par différents outils afin de valider la technique développée au sein du laboratoire. (INSERM-Centre de Biochimie Structurale - Montpellier- Gilles LABESSE: gilles.labesse@cbs.cnrs.fr) ** Menssouri Naoual
Stage 30 : Targetting of annexin A5 through structure-based virtual ligand screening. In this project we aim to discover and optimize small molecules or peptides that inhibit the cellular functions of Annexing A5 through a structural bioinformatics approach. (UNIVERSITY OF MAASTRICHT Cardiovascular Research Institute Maastricht - Gerry NICOLAES: g.nicolaes@maastrichtuniversity.nl) ** Sevellec Yann