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List of Internships M2 Year 2014-2015


Last update : 1/12/2014
Title of internships ** Selected internships
Stage 1 : Simulation of transport properties of porins from the Outer Membrane of Gram-negative bacteria (Training supervisor: Prof. Matteo Ceccarelli)  
Stage 2 : Modélisation moléculaire (Structure-based approach Drug Design-Ligand-based approches Drug Design-Structure peptide / Oligosaccharid) (Training supervisor: François-Régis Chalaoux (Sanofi - Toulouse))  
Stage 3 : Etudes de docking et dynamique moléculaire dans le cadre d’un projet polypharmacologique (Training supervisor: Pierre Ducrot (Servier))  
Stage 4 : Prédiction de ligands peptidiques du complexe majeur d’histocompatibilité par design computationnel de protéines. (Training supervisor: Thomas Gaillard)  
Stage 5 : Efficient inclusion of precomputed unbound ensembles in docking (Training supervisor: Juan Fernandez-Recio) Imen Daoud
Stage 6 : Classification of protein-protein interfaces as drug targets (Training supervisor: Juan Fernandez-Recio) Nadia Arezki
Stage 7 : Supramolecular organization of opioid receptors and their biological partners (Training supervisor: Daniel P. Vercauteren) Robin Cosquier
Stage 8 : Study of the Interaction Mode of IDO Inhibitors by Steered Molecular Dynamics. (Training supervisor: Antonio Macchiarulo) Answald Bournique
Stage 9 : Ingénierie des interactions protéine-ligand (Training supervisor: Thomas Simonson) Xingyu Chen
Stage 10 : Structural chemistry of the RNA methylation pathway: binding site analysis and drug design. (Training supervisor: Pr. Matthieu Schapira)  
Stage 11 : Design of novel peptide-competitive compounds against key histone lysine demethylases (Training supervisor: Brian Marsden) Hélène Pierson
Stage 12 : Etude des nouveaux outils de chemo-informatique en FBDD (Fragment Based Drug Design) (Training supervisor: Laboratoire Pierre Fabre)  
Stage 13 : Participer par la mise en place et la réalisation d’un criblage in silico de produits naturels puis de techniques phyto-chimiques afin d’aboutir àla mise au point d’extraits végétaux, d’ingrédients de formules pharmaceutiques ou cosmétiques (Training supervisor: Laboratoire Pierre Fabre)  
Stage 14 : Prediction of receptor-ligand binding affinities using molecular dynamics simulations (Training supervisor: Dr. Jens Carlsson) P. Matricon
Stage 15 : Design of peptides and small molecules targeting protein-protein interactions (Training supervisor: Stefano Pieraccini)  
Stage 16 : Computational modeling of peptidomimetic molecules targeting protein-protein interactions (Training supervisor: Dr. Laura Belvisi and Dr. Monica Civera)  
Stage 17 : Study protein-ligand interactions at an atomic and electronic and atomic energy level. Improving PELE's score functions (Training supervisor: Victor GUALLAR TASIES) Joan Clarknicolas
Stage 18 : Targetting of NETosis through structure-based virtual ligand screening (Training supervisor: Gerry Nicolaes & Kanin Wichapong) Sidy Casse
Stage 19 : Molecular dynamics on a potassium channel KirBac3.1 (Training supervisor: Catherine Vénien-Bryan et David Perahia )  
Stage 20 : New inhibitors for Cytochrome P450 17A1 - A Potential Anti-Cancer Target (Training supervisor: Flemming Steen Jørgensen ) Bogac Ercig
Stage 21 : Evaluation de l’activité de perturbation endocrine de polluants environnementaux à l’aide d’outils bio-informatiques (Encadré par : William Bourguet) Audrey Deyawe
Stage 22 : Selective small molecule inhibitors of LMW-PTP (Training supervisor: Alexandra NaB) Emna Saied
Stage 23 : Prédiction de la stabilité conformationnelle de fragments de protéines (Training supervisor: Dirk Stratmann)  
Stage 24 : Stage en Chemoinformatique - OriBase Pharma - www.oribase-pharma.com - Gwénaël Chevé : gcheve@oribase-pharma.com  
Stage 25 : Application d’une méthode de classification des poches pour prédire les effets secondaires médicamenteux.(Training supervisor: O. Taboureau) Laetitia Desjardin
Stage 26 : Constitution d’une chimiothèque corporate de fragments en associant des fragments issus de recherche interne et la sélection de fragments de founisseurs extérieurs. Application aux différents projets internes utilisant des fragments. Mise en place de méthodes de scoring de développabilité de molécules CNS (MPO) (Training supervisor:: Philippe Schambel - Institut de recherche Pierre Fabre) Alexandre Cabaye
Stage 27 : Etudes par dynamique moléculaire d’un canal à potassium KirBac3.1 (Training supervisor: Venien-Bryan Catherine - UPMC Paris) Aline De Araujo
Stage 28 : Etude des sous-populations cellulaires de la moelle osseuse par cytométrie en flux, à l’aide d’une combinaison de 8 anticorps (Training supervisor: Campos Lydia) Kesr Sanae