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S1 Univ. Strasbourg
S2 Univ. Milan
S3 Univ. Paris Diderot
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/
Internships M2 2016-2017
List of Internships M2 Year 2016-2017
last update 9/12/2016
Title of internships
** Selected internships
Stage 1 :
Nucleic acids coarse-grained modeling (Training supervisor: S. Pasquali)
Stage 2 :
Stages Finlande Helsinki (Training supervisor: H. Xhaard)
Stage 3 :
Modélisation moléculaire de la formation d’amyloïdes fonctionnelles (Training supervisor: F. Gobeaux)
Stage 4 :
Conception et validation d’un outil de criblage virtuel basé sur des pharmacophores directement déduits de la structure 3D de sites de liaisons droguables (Training supervisor: D. Rognan)
M. Amoussou
Stage 5 :
Developing specific inhibitors of the enzyme ALDH1A2 (Training supervisor: GUVENCH OLGUN)
B. Touzeau
Stage 6 :
Approches chemoinformatiques pour la mise à jour et l’analyse de données chimiques et pharmacologiques de modulateurs d’interactions protéine-protéine. (Training supervisor: O. Sperandio)
Stage 7 :
Un nouveau paradigme Le projet MDFT. (Training supervisor: M. LEVESQUE et C. GAGEAT)
J. François
Stage 8 :
Développement d’outils in silico pour l’étude d’inhibiteurs de kinases (modes de liaison, activité, sélectivité etc.) (Training supervisor: Dr M. Lopez Ramos & Dr D. Bucher)
L. Ait-Ouarab
Stage 9 :
Prédiction structurale des interactions protéine-protéine en utilisant l’information évolutive (Training supervisor: J. ANDREANI et R. GUEROIS)
Stage 10 :
Identification of potent and selective CYP26 inhibitors based on homology modeling and virtual screening. (Training supervisor: K. Pors )
Stage 11 :
Etude du transporteur de glucose et ses mécanismes de transport (Training supervisor: C. Etchebest )
S. Abbar
Stage 12 :
Studies of binding for a peptide to RNA. (Training supervisor: Pr David J. Wales)
M. Choffe
Stage 13 :
From SMARTCyp towards a Virtual Liver (Training supervisor: Flemming Steen Jørgensen)
Stage 14 :
Application of protein-protein docking to help caracterizing disease-related mutations for personalized medicine (Training supervisor: J. Fernández-Recio)
A. Moine-Franel
Stage 15 :
Study of antigen-antibody complexes. (Training supervisor: A. Karlsson & M. Bianciotto)
J. Vucinic
Stage 16 :
Benchmarking different computational approaches for the calculation of the ligand binding free energy with applications both to host-guest and protein-ligand systems. (Training supervisor: )
P. Pacak
Stage 17 :
Etude par simulation de dynamique moléculaire de l’interaction de la caspase 3 avec des peptides cycliques issus de son interface de dimérisation. (Training supervisor: D. Stratmann )
Stage 18 :
Le dessin computationnel de protéines: mesures de performance et nouveaux développements (Training supervisor: T. Simonson)
Stage 19 :
Development of a SARI approach based on pharmacophore fingerprint and assessment with side effects clinical outcomes (Training supervisor: O. Taboureau)
Stage 20 :
Allostérie Structurale de l’intégrine αIIbβ3 (Training supervisor: A. de Brevern)
Stage 21 :
Ligand reconstruction in binding sites at a polypharmacological level by mining PDB existing data embedded in a Chemo-proteomic programming interface. (Training supervisor: Ch. Meyer/Centre de Recherche Janssen-Cilag)
O. Béquignon
Stage 22 :
Recherche de modulateurs d’épissage (Training supervisor: C. Bauvais, G.BOLLOT/SYNSIGHT SAS)
Stage 23 :
Interactions peptide-protéine : méthodes de dynamique moléculaires accélérées pour l’affinage et le scoring des poses. (Training supervisor: P. Tufféry)
Stage 24 :
Computational design of novel peptidomimetic inhibitors of cadherin homophilic interactions (Training supervisor: Dr. Monica Civera/Prof. Laura Belvisi)
Stage 25 :
Molecular modeling of binuclear tubulin targetting compounds (Training supervisor: Dott. Stefano Pieraccini)
Stage 26 :
Modeling enzymes orientations on electrode surfaces for green energy production (Training supervisor: Sophie Sacquin-Mora )
Stage 27 :
Reliability of RNAi data for predicting of response to compound data on cancer cell lines. (Training supervisor: Antoine De Weck/Novartis )
D. Naga
Stage 28 :
Conception et réalisation d’un criblage in silico techniques phytochimiques permettant l’extraction et l’analyse des extraits végétaux identifiés et destinés à des formules pharmaceutiques ou cosmétiques. (Training supervisor: LETI Mathieu )
L. Trisson
Stage 29 :
Detection of genes and pathways modulated in neoplastic and microenvironment cells as a result of their physical interaction using single cell RNA-seq data.(Training supervisor: Valentina BOEVA )
Y. Yousfi
Stage 30:
Définition d’un Espace conformationnel commun aux GPCR de classe A par Dynamique Moléculaire (Training supervisor: Bruno CORNET)
Z. Si Chaib
Stage 31 :
Nouvelles cibles thérapeutiques pour la sclérose en plaques : les analogues des récepteurs du VIP et du PACAP (Training supervisor: Jana Sopkova)
Stage 32 :
Régulation de la voie de signalisation Hedgehog : modélisation à partir de données SAXS et cristallographie de la protéine SUFU (Training supervisor: V. Biou)
A. GRINE
Stage 33 :
Développement d’outils de docking sur les gaz/ protéines membranaires (Training supervisor: P. PULLUMBI)
R. Hammouche
Stage 34 :
homologie comparative criblage virtuel (Training supervisor: F. Amaury)
F. Chibat
Stage 35 :
Statistical analysis of the known conformational space of protein-bound ligands This subject(Training supervisor: J. Kirchmair)
M. Simsir
Stage 36 :
building hybrid models combining molecular dynamics and machine learning for predicting protein-ligand interactions (Training supervisor: R. Juho)
M. Jabri
Stage 37 :
structure et évolution des gènes de novo (Training supervisor: A. Lopes)
Stage 38 :
Capacité à mettre en place et suivre une démarche scientifique avec des outils in silico. (Training supervisor: J. Fogha)
R. Miguel