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Liste des stages M2 Année 2013-2014


Dernière mise à jour : 22/01/2014
Titres des stages ** Stages déja retenus
Stage 1 : Prédiction de la Cinétique des inhibiteurs de protéines kinases et de leur Affinité par Docking flexible. (Encadré par : N. Garnier/S. Aci-Sèche)  
Stage 2 : Expanding template-based protein-protein complex prediction by energy-based docking. (Encadré par : Juan Fernandez-Recio)  
Stage 3 : Free energy calculations in halogen bonded systems of biological relevance. (Encadré par : Stefano Pieraccini)  
Stage 4 : Insights into Structural and Conformational Features Affecting Ligand Selectivity in IDO1 and IDO2. (Encadré par : Antonio Macchiarulo)  
Stage 5 : Optimizing the hydrogen-bond network in GPCR models. (Encadré par : Alexandre Borrel) Ali Bakiri
Stage 6 : Investigation of alternate polymers to poly(ethylene) glycol (PEG) Projects 1 and 2 (Encadré par : Alex Bunker)  
Stage 7 : La spécificité d’un ligand pour un CYP est-elle reliée à son affinité pour un canal d’accès particulier? (Encadré par : Claire Minoletti (SANOFI)) Ziada Sonia
Stage 8 : Etude in silico sur l’impact du polymorphisme des cytochromes P450 sur la reconnaissance des ligands et l’efficacité des médicaments (Encadré par : M. Miteva)  
Stage 9 : Développement et validation d’outils computationnels de design des interactions enzyme-substra (Encadré par : S. Barbe)  
Stage 10 : De novo in silico design of monoclonal antibodies (Encadré par : Anke Steinmetz (SANOFI))  
Stage 11 : Targetting of NETosis through structure-based virtual ligand screening. (Training supervisor : Gerry Nicolaes & Kanin Wichapong)  
Stage 12 : Targetting of Annexin A5 through structure-based virtual ligand screening. (Training supervisor : Gerry Nicolaes & Kanin Wichapong)  
Stage 13 : Chemoinformatique sur l’analyse de réseaux de relations structure/activité, soit modélisation pour l’étude d’interactions protéine/ligand par dynamique moléculaire.(Encadré par : Pierre Ducrot (Servier))  
Stage 14 : Evolution des récepteurs-canaux pentamériques et interactions avec les lipides. (Encadré par : J. Hénin) Mariama Jaiteh
Stage 15 : Développer et optimiser un modèle permettant de prédire les propriétés physico-chimiques, biologiques ou toxicologiques des molécules en fonction de leur structure. (Laboratoire GALDERMA - Nice)  
Stage 16 : Docking of low molecular weight compounds in the active site of human Proteinase 3 (Encadré par : N. Reuter) Jean Baptiste Cheron
Stage 17 : Prédiction de la stabilité conformationnelle de peptides dérivés de fragments de protéines. (Encadré par : Dirk Stratmann)  
Stage 18 : Biochimie Structurale : Cristallisation de protéines (Laboratoire GALDERMA - Nice)  
Stage 19 : Les mouvements du microtubule en dépolymérisation étudiés par les modes normaux à partir des coordonnées atomiques et des images de microscopie électronique (Encadré par : Liliane Mouawad) Mario Cano Contreras
Stage 20 : 3D implementation and validation of Discngine Pharmacophore Graph (Encadré par : Vincent le Guilloux & Peter Schmidtke - Discngine SAS)  
Stage 21 : Développement d’une technique de scoring dans un contexte de docking inverse. (Greenpharma S.A.S.)  
Stage 22 : Simulations des dynamiques moléculaires classiques des porins de bactérie Gram-Negatives (Encadré par : Prof. Matteo Ceccarelli) Dehbia Benkerrou
Stage 23 : Dessein computationnel des interactions protéine-ligand (Encadré par : Pr. Thomas Simonson) omarjee eyaz
Stage 24 : Identification of small molecules binding to PHIP protein and development of potent and selective chemical probes. (Encadré par : Dr. Brian Marsden) HASHEM Shaima
Stage 25 : Defining chemical tractability profile of proteins involved in histone methylation pathways, and proposing novel avenues to develop focused chemical libraries. (Encadré par : Matthieu Schapira) Alexandre Cabayé
Stage 26 : Homo et hétéro oligomérisation des récepteurs opiodes. (Encadré par : Daniel VERCAUTEREN) Justine Houndekon
Stage 27 : Identifier de nouveaux partenaires protéine-ligand par une approche de pharmacophore 3D à partir de classes de complexes (Encadré par : Delphine Flatters ) DEYAWE KONGMENECK Audrey
Stage 28 : Etude par dynamique moléculaire d’un canal à potassium, KirBac3,1 à état ouvert et ferme. (Encadré par : Catherine Venien-Bryan - UPMC) MHOUMADI Yasmina
Stage 29 : Modélisation QSPR pour établir statistiquement des relations entre la structure de molécules et la phototoxicité. (Encadré par : Etienne Thoreau - Galderma R&D) PETREA Olivia
Stage 30 : Suggestion et validation de nouveaux activateurs de la Paroaxanase 1 (Encadré par : Olivier Taboureau) SOW Ibrahima